Dal 1999 AXSE Srl adotta un Sistema di Gestione per la Qualità certificato secondo la norma UNI EN ISO 9001 (Certificato CERTIQUALITY n. 2.723).
Nel 2002 AXSE Srl ha implementato e certificato il proprio Sistema Integrato di Gestione Qualità, Ambiente e Sicurezza, ottenendo le certificazioni UNI EN ISO 9001, UNI EN ISO 14001 (Certificato CERTIQUALITY n. 4.846) e ISO 45001 (Certificato CERTIQUALITY n. 4.847).
Nello stesso anno ha conseguito da CERTIQUALITY il Certificato di Eccellenza n. 022, riconosciuto alle aziende che hanno ottenuto la certificazione dei tre Sistemi Qualità, Ambiente e Sicurezza.
Nel 2005 AXSE Srl ha ottenuto la registrazione EMAS (registrazione n. I-000474) ai sensi del Regolamento CE 1221/2009 e s.m.i., con convalida della Dichiarazione Ambientale.