Dal 1999 AXSE ha un Sistema Qualità certificato secondo la norma UNI EN ISO 9001 (Certificato CERTIQUALITY n. 2.723).
Nel 2002 AXSE ha raggiunto il traguardo di implementare e certificare il proprio Sistema Integrato di Gestione Qualità, Ambiente (certificato CERTIQUALITY n. 4.846) e Sicurezza (certificato CERTIQUALITY n. 4.847), in accordo rispettivamente alle norme UNI EN ISO 9001, UNI EN ISO 14001 e ISO 45001, conseguendo pertanto da CERTIQUALITY il prestigioso Certificato di Eccellenza n. 022, riconosciuto alle aziende virtuose che hanno ottenuto la certificazione dei tre Sistemi Qualità/Ambiente/Sicurezza.
Infine nel 2005 è stata raggiunta la registrazione EMAS (registrazione n. I-000474), secondo il Reg. CE 1221/2009 e s.m.i., con la convalida della Dichiarazione Ambientale.